Half-Life läuft im OpenGL Mode unter Linux, Valve hat sich wirklich gute Mühe gegeben, möglichst wenig API-Funktionen zu verwenden, auch wenn die damals bestimmt noch nicht an WINE gedacht haben.
Notepad läuft auch auf Linux.
Allgemein kann man sagen: Manches läuft, anderes nicht. Musst also ausprobieren.
Außerdem gibt es Open-Source Abbrevanten der meisten Windows-Software, zum Beispiel LICQ als ersatz für ICQ, der Mozilla Firefox wurde ja eh für Linux entwickelt, als Gnutella-Client gibt es Gnucelus, als mIRC Ersatz gibt es LIRC, ...