Master / Slave klingt erstmal nach PATA Platte.
Damit würde ich radikal auf ne verdrehte Boot Order tippen. Schau mal im Bios nach, ob er die Platte überhaupt unter den Boot Geräten gelistet hat - und ob die Reihenfolge stimmt.
Ein typischer Fehler wäre auch ne Diskette im Laufwerk - aber dafür halte ich Dich eigentlich für zu intelligent
Möglich wäre auch irgendein Programm, welches den MBR überschrieben hat - und da das Boot Flag deaktiviert hat (ich komme jetzt gerade net auf dem Namen wie das genau hieß).