Probier doch mal Speedfan damit habe ich gute Erfahrungen gemacht:
SpeedFan - Access temperature sensor in your computer
Ansonsten würde mir einfallen die Lüfter elektrisch zu drosseln sprich ein Lüfterkabel mit einem festen Widerstand oder einem Poti zu verwenden siehe unten:
7 Volt Anschlusskabel InLine Stufenlose Lüfterregelung, Drehpotentiometer: Amazon.de: Elektronik