Da die Treiber für den SATA Controller nicht in Windows vorhanden sind musst du sie natürlich vorher installieren um darauf Windows installieren zu können.
Dazu musst du dir den Treiber (sollte einer auf der CD zum Mainboard drauf sein) auf eine Diskette kopieren und beim Starten von der WindowsCD dann wenn du dazu aufgefordert wirst die "F6" Taste drücken um einen SCSI Treiber zu installieren.
Windows bindet den SATA Controller dann als SCSI Gerät ein.
Selbstverständlich ist SATA kein SCSI, aber die Treiber sind nunmal so für diese Schnittstelle geschrieben, von daher brauchst du da dich nicht drüber wundern