Wenn du Windows eh auf der SATA Platte hast und die IDE Platte abgesteckt hast, dann starte mal in die Reperaturkonsole (ist auch ne F Taste, die man während der Installation drücken muss. Musst einfach mal abwarten.)
Dort gibst du dann folgende zwei Befehle ein:
Dann müsste er den MBR neu und richtig schreiben und den Bootsektor der Windowspartition.