Kann man so nicht sagen. Du musst schon Chipsätze nennen! Ich übertreib jetzt mal und sag ne 6800 Ultra (nVidia) ist besser als ne ATI9500. Wiederrum ist ne X850XT besser als ne Geforce 5600 (nVidia)

Also du siehst, kann man nicht vergleichen, da völlig andere Chipsatzdimension. Sag welche Chipsätze du meinst (z.B. Geforce 6800 VS. X800), da kann man das schon eher beurteilen. Im Prinzip sind beide gut
Ob PCI-E oder AGP ist im Prinzip egal (von der Geschwindigkeit). Jedoch werden in Zukunft nur noch Karten für PCI-E erscheinen. Also wenn du dir nen komplett neuen PC holst, kauf dir auf jeden Fall ein Board mit PCI-Express.