Wie Zad schon gesagt hat, würde ich auch zunächst die pasive Kühlung des Chipsatzes überprüfen. Dass der Chipsatz zu heiss wird hast du ja schon zu spüren bekommen.
Ist nur die Frage, ob du daran rumschrauben/den Kühler austauschen möchtest. Ich weiss ja nicht wie kulant dein Händler bei sowas reagiert. Nicht, dass der dann die Schuld für die überhöhte Temp deinen Reparaturversuch ankreidet und die Gewährleistung futsch ist...
Evtl vorher anrufen und rückversichern lassen, dass das iO geht.
Ich gehe auch davon aus, das der Wert der 5V Schiene falsch ausgelesen wird. Allerdings würde ich schauen, dass ich zunächst ein anderes NT von einem Freund verwende, um das NT als Ursache aussen vor zu halten.
Zu den Piepcodes: im Manual steht
"Continuous long beeps: DRAM error
Continuous short beeps: Power error"
Zum RAM: auch den würde ich auf dem Ersatzmobo dann erst noch mal mit memtest testen s.o..