Ich hatte in der Firma auch schonmal das selbe Problem!
Alle die es nicht wahrhaben wollen: Der IE öffnet nur ein Fenster und selbst wenn man ihn nochmal starten will, oder STRG+N oä drückt bleibt nur das eine Fenster! Wenn man auf einer Seite war und dann noch einen IE starten will geht das offene Fenster wieder auf die Startseite.. Ich hab damals ewig rumprobiert, updates installiert etc und schlussendlich Windows neuinstalliert

Ist zwar nicht der beste Tipp, aber danach gings wieder
Ansonsten Firefox benutzen und den IE links liegen lassen!