[EoN]

Die Signatur des Apaches ist wohl ausgestellt. Aber daran kannst Du nichts ändern. Das ist vom Hoster so vorgegeben.
@Tele: Sollte die Signatur nicht normalerweise auch auf phpInfo Seite mit auftauchen?

Sehr komisch das ganze. Kannst Du das Passwort ändern für den FTP Zugang? Wenn ja dann änder das doch mal und speicher es nicht im FTP Programm mit ab.

Zusätzlich schau bitte mal, ob Du wirklich von dem FClick CMS die neueste Version installiert hast. Vielleicht hat sich da ja auch eine Sicherheitslücke eingeschlichen, die von irgendjemandem ausgenutzt wird.