Bei echten HW-Raid-Controllern (3ware o.ä.) ist die Reihenfolge egal. Da speichert der Controller eine eindeutige Kennung auf der Platte, durch die die Reihenfolge bestimmt werden kann.
Ob das allerdings bei den günstigen (Onboard-)Controllern auch so ist, weiss ich nicht. Mit sowas hab ich keine Erfahrung