Seit wann lassen sich mit MBM denn Lüfter regeln?
UnoOC
EDIT: In der Version 4.32 gibt es unter Konfigurieren --> Optionen ein Feld "100% Leistung wenn das Programm geschlossen wird"; wenn dort ein Haken bei dir wäre, könnte es daran liegen.
Alternativ eine Hardwarelösung verwenden