zu 1.:
Windows 2003 sollte das meines Wissens auch selbst können.
Wie das geht kannste ja mal hier schauen:
Wie Software Raid unter Windows 2003 erstellen ? - administrator
Ein eigener "billig" Raid Controller macht es auch nicht besser - vor allem wenn der seine Daten dann noch über den PCI Bus schaufeln muss.
Leider hast Du keine Hardwaredaten gepostet - somit kann ich da nix weiter sagen.
zu 2.:
Bitte beschreibe erstmal Deine Hardware (CPU, Mainboard, Ram, Festplatten).
Weiterhin wäre interessant, was Du da genau mit der Kiste machst, wenn Du "Haufen" Daten immer hin und herschaufelst.
Dann können wir drüber reden ob sich eine solche Investition auch lohnt.