Welches mir sehr gut gefällt ist "g4l" da es klein ist und für ein Konsolenprogramm sehr übersichtlich ist. Zudem ist dem Programm die Formatierung der Platte egal, es liest Bit für Bit.
Hier eine Anleitung für die Sicherung auf FTP-Servern (was anderes konnte ich leider nicht finden):
HowtoForge Linux Tutorials Wie man Festplatten und Partitionen mit Ghost4Linux sichert/wiederherstellt