Ach, als Betriebssystem geht jedes Linux-System ganz gut, es gibt aber auch extra für Folding zugeschnittene Systeme.
Folding@Home - VMWare Player 3.0 and Folding Bigadv Support - LinuxForge.net
Nur wie gesagt, VMWare sollte man nicht mehr benutzen, da bietet sich VirtualBox doch eher an.