Offiziell sollte er eigentlich mit CDRoms/DVDRoms klar kommen!
Laut FAQ:
Will my Ultra100 work with a CD-ROM, or other ATAPI device? (Eintrag 11)
sollte es eigentlich unter einem PNP Betriebssystem gehen! Kann also sein - das Deine Treiber nicht korekt installiert sind!
Die bessere Alternative ist aber, wie oben schon erwähnt, die Platten an den extra Kontroller zu hängern, und die Atapi Geräte an die onBoard Anschlüsse des Mainboards.