Kann evtl. auch an unausgereiften 64-Bit Treibern liegen. Dual-GPU Lösungen sind ja bekannt dafür, massive Treiberprobleme zu haben, das ist auch mit der neuesten Generation nicht anders (HD3870 X2, 9800 GX2). Von daher würde ich grundsätzlich auf eine Dual-GPU Karte verzichten.
Dass du mit einer zweiten HD3870 X2 nur 100 Punkte mehr hast (wozu eigentlich die zweite

) wird wohl daran liegen, dass der 3DMark06 kein Quad-Crossfire unterstützt nehme ich an. Und ein 600W Netzteil für 2 HD3870 X2 halte ich auch für ein wenig schwachbrüstig. die Karten alleine werden dir unter Volllast sicherlich nahezu 400W fressen.