Hast du die Installation ohne RAID Controllerkarte versucht, wenn die Karte im unteren PCI-E "16x" (eigentlich 8x) steckt? (Testweise könntest ja eine von den Platten On-Board anschließen)
Ich könnte mir vorstellen, dass es das Windows bzw. das BIOS nicht verkraftet, beim ASUS 890GX wurde bei den Tests immer hervorgehoben, dass der untere der Standardslot ist.
EDIT: Theoretisch müsste die Anbindung der SB sogar besser sein, da sie schon PCIe 2.0 nutzt.
EDIT2: PCIe x4 muss in einem PCIex16 Slot nicht funktionieren (lt.
http://www.elektronik-kompendium.de/...om/0904051.htm)