Naja, es bringt schon was. Kommt echt auf den Rechner an. Ich hatte meinen PCI-Express auf 125 MHz - dannach stieg die Graka aus - bei Benchmarks hat das teilweise schon was gebracht, zumal ich durch die Erhöhung des PCIEx den CPU auch höher takten konnte. Jedoch lief der Rechner nicht wirklich stabil.
Das bringt höchstens dann was, wenn - wie in Deinem Fall - der PCIe-Takt an den HT-Takt gekoppelt ist und Deine CPU ebenfalls übertaktet wird. Ansonsten ist das bissel mehr PCIe-Durchsatz wirklich nicht entscheidend. Bei PCIe-x16 ist die Bandbreite gegenüber AGP schon doppelt so hoch, und selbst sind die effektiven Geschwindigkeitsunterschiede nur in Einzelfällen überhaupt messbar.