Nach dem ersten Start fragt das Programm einige Grundeinstellungen ab und aktualisiert sich automatisch über das Internet. Der erste Scan verläuft relativ zügig, allerrdings erkennt das Programm auch "harmlose" Programme wie z.B. den Downloadmanager Flashget als Spyware. Nachdem der Scan fertig ist, bekommt man eine übersichtliche Liste mit allen erkannten Programmen. Meistens schon mit Vorschlägen, wie mit ihnen zu verfahren ist. Im Fall von Flashget war die Voreinstellung bereits "ignore".
Microsoft AntiSpyware wird momentan nur in Englisch angeboten. Herunterladen können Sie es bei Microsoft, die Größe beträgt rund 6,5 MByte. Das Programm funktioniert mit Windows-Versionen ab Windows 2000.